Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.2Q85ZW9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms