Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms