Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms