Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms