Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
AknaQ80VW7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AknaQ80VW7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AknaQ80VW7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms