Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Avl9Q80U56 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms