Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2q1Q7TSS2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2q1Q7TSS2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2q1Q7TSS2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2q1Q7TSS2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2q1Q7TSS2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2q1Q7TSS2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2q1Q7TSS2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2q1Q7TSS2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Ube2q1Q7TSS2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2q1Q7TSS2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms