Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IfnkQ7TSL0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms