Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms