Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf139Q7TMV1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf139Q7TMV1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms