Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms