Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms