Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Efr3bQ6ZQ18 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Efr3bQ6ZQ18 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Efr3bQ6ZQ18 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Efr3bQ6ZQ18 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Efr3bQ6ZQ18 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Efr3bQ6ZQ18 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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Efr3bQ6ZQ18 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Efr3bQ6ZQ18 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Efr3bQ6ZQ18 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efr3bQ6ZQ18 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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Efr3bQ6ZQ18 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Efr3bQ6ZQ18 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Efr3bQ6ZQ18 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3bQ6ZQ18 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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