Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms