Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms