Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE7

Slc6a7, Sodium-dependent proline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a7Q6PGE7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a7Q6PGE7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms