Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mfsd13aQ6PDE8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms