Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Podnl1Q6P3Y9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Podnl1Q6P3Y9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms