Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23ipQ6NZC7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23ipQ6NZC7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms