Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HelbQ6NVF4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms