Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ltv1Q6NSQ7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms