Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hecw2Q6I6G8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hecw2Q6I6G8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms