Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms