Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nop58Q6DFW4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nop58Q6DFW4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms