Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rftn1Q6A0D4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms