Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thsd7aQ69ZU6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thsd7aQ69ZU6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thsd7aQ69ZU6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Thsd7aQ69ZU6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thsd7aQ69ZU6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thsd7aQ69ZU6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thsd7aQ69ZU6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thsd7aQ69ZU6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Thsd7aQ69ZU6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thsd7aQ69ZU6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thsd7aQ69ZU6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thsd7aQ69ZU6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thsd7aQ69ZU6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thsd7aQ69ZU6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thsd7aQ69ZU6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7aQ69ZU6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms