Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc2Q69ZB8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms