Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef39Q66JY6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms