Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q66JV7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q66JV7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q66JV7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q66JV7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q66JV7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q66JV7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q66JV7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q66JV7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q66JV7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q66JV7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q66JV7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q66JV7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q66JV7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q66JV7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q66JV7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q66JV7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q66JV7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q66JV7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Q66JV7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q66JV7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Q66JV7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q66JV7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q66JV7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q66JV7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q66JV7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q66JV7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q66JV7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q66JV7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q66JV7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q66JV7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q66JV7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q66JV7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q66JV7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q66JV7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q66JV7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q66JV7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q66JV7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q66JV7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q66JV7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q66JV7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q66JV7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q66JV7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q66JV7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q66JV7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q66JV7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q66JV7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q66JV7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q66JV7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q66JV7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q66JV7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q66JV7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q66JV7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q66JV7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Q66JV7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q66JV7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q66JV7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q66JV7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q66JV7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Q66JV7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q66JV7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Q66JV7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q66JV7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q66JV7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms