Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PatjQ63ZW7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PatjQ63ZW7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms