Protein–RNA interactions for Protein: Q63739

Ptp4a1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a1Q63739 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptp4a1Q63739 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms