Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CochQ62507 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CochQ62507 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CochQ62507 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CochQ62507 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CochQ62507 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CochQ62507 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CochQ62507 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CochQ62507 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CochQ62507 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CochQ62507 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CochQ62507 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CochQ62507 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CochQ62507 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CochQ62507 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CochQ62507 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CochQ62507 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CochQ62507 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CochQ62507 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CochQ62507 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CochQ62507 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CochQ62507 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CochQ62507 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CochQ62507 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CochQ62507 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CochQ62507 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CochQ62507 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CochQ62507 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CochQ62507 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CochQ62507 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CochQ62507 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CochQ62507 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CochQ62507 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CochQ62507 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CochQ62507 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CochQ62507 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CochQ62507 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CochQ62507 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CochQ62507 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CochQ62507 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CochQ62507 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CochQ62507 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CochQ62507 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CochQ62507 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CochQ62507 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CochQ62507 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CochQ62507 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CochQ62507 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CochQ62507 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms