Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa13Q62424 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms