Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tff3Q62395 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff3Q62395 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff3Q62395 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff3Q62395 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff3Q62395 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff3Q62395 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff3Q62395 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tff3Q62395 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff3Q62395 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff3Q62395 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff3Q62395 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff3Q62395 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff3Q62395 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff3Q62395 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff3Q62395 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff3Q62395 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tff3Q62395 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tff3Q62395 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tff3Q62395 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tff3Q62395 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Tff3Q62395 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Tff3Q62395 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tff3Q62395 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tff3Q62395 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tff3Q62395 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tff3Q62395 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tff3Q62395 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tff3Q62395 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tff3Q62395 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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