Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt6hQ62383 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt6hQ62383 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms