Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sall3Q62255 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sall3Q62255 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms