Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd180Q62192 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms