Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prm3Q62100 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms