Protein–RNA interactions for Protein: Q61923

Kcna6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna6Q61923 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kcna6Q61923 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna6Q61923 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms