Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prg2Q61878 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms