Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd47Q61735 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd47Q61735 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd47Q61735 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd47Q61735 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd47Q61735 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd47Q61735 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd47Q61735 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd47Q61735 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd47Q61735 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd47Q61735 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd47Q61735 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd47Q61735 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd47Q61735 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd47Q61735 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd47Q61735 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd47Q61735 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms