Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrxQ61687 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms