Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd55bQ61476 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd55bQ61476 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd55bQ61476 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd55bQ61476 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd55bQ61476 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd55bQ61476 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd55bQ61476 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd55bQ61476 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd55bQ61476 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd55bQ61476 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms