Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msi1Q61474 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msi1Q61474 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms