Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcd1Q61466 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcd1Q61466 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms