Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Acvr1bQ61271 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms