Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac3Q60931 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms