Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Neurod1Q60867 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Neurod1Q60867 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms