Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms