Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atf3Q60765 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms